修复 Native shell 作业在测试阶段才解析 crates.io index 的缺口

- .gitea/workflows/project-ci.yml：Native shell tests 新增「Prepare standalone Rust crate dependencies」步骤，
  对被 server-rs workspace exclude 的 agent-runtime-core / agent-runtime-orchestration 先做 cargo fetch，
  把它们在测试阶段的 registry 解析与下载提前到依赖准备阶段；两 crate 未提交 Cargo.lock，故不能带 --locked
- scripts/project-ci-workflow.test.ts：新增用例钉住该步骤存在、覆盖两个独立 crate manifest、且命令不带锁标志

根因与影响见 #327：此前这两个 crate 只在 agent-runtime-*:check 中现场 `Updating crates.io index`，
crates.io 一抖动整条 native shell 作业就红（PR #316 run 1950）。

.gitea/workflows/project-ci.yml

@@ -232,6 +232,37 @@ jobs:
             done
           done
 
+      - name: Prepare standalone Rust crate dependencies
+        shell: bash
+        run: |
+          set -euo pipefail
+          # agent-runtime-core / agent-runtime-orchestration 被 server-rs/Cargo.toml 的
+          # exclude 排除，不参与上面的 workspace 锁文件，因此上面那次锁定 fetch 覆盖不到它们；
+          # 而 check:native-shells 会经 agent-runtime-*:check 用 `cargo test --manifest-path`
+          # 单独跑这两个 crate。不在这里预热的话，这两条测试会在测试阶段自己
+          # `Updating crates.io index`，crates.io 一抖动整条 native shell 作业就红
+          # （见 #327 / PR #316 run 1950）。
+          # 两个 crate 都没有提交 Cargo.lock，所以这里只能做不带锁标志的 fetch：
+          # 加锁标志会因为缺少锁文件直接失败。生成的 Cargo.lock 落在两个 crate 目录内，
+          # 已被各自的 .gitignore 忽略，只留在容器里；随后的测试阶段因此能用锁定版本
+          # 解析，不再触碰 registry index。
+          for manifest_path in \
+            server-rs/crates/agent-runtime-core/Cargo.toml \
+            server-rs/crates/agent-runtime-orchestration/Cargo.toml; do
+            for attempt in $(seq 1 5); do
+              if cargo fetch \
+                --target x86_64-unknown-linux-gnu \
+                --manifest-path "${manifest_path}"; then
+                break
+              fi
+              if [[ "${attempt}" -eq 5 ]]; then
+                echo "standalone crate dependency fetch failed after 5 attempts: ${manifest_path}" >&2
+                exit 1
+              fi
+              sleep $((attempt * 2))
+            done
+          done
+
       - name: Run native shell gates
         run: npm run check:native-shells
 

scripts/project-ci-workflow.test.ts

@@ -321,4 +321,26 @@ describe('project CI workflow', () => {
     expect(nativeJob).toContain('server-rs/Cargo.toml');
     expect(nativeJob).toContain('cargo fetch --locked');
   });
+
+  it('prefetches the excluded standalone Rust crates before the native shell gates', () => {
+    const standaloneStep = stepSection(
+      'native-shell-tests',
+      'Prepare standalone Rust crate dependencies',
+    );
+    for (const manifest of [
+      'server-rs/crates/agent-runtime-core/Cargo.toml',
+      'server-rs/crates/agent-runtime-orchestration/Cargo.toml',
+    ]) {
+      expect(standaloneStep).toContain(manifest);
+    }
+    // 这两个 crate 没有提交 Cargo.lock，只能用不带 --locked 的 fetch：
+    // 带 --locked 会因为缺少锁文件直接失败。
+    expect(standaloneStep).toContain('cargo fetch \\');
+    expect(standaloneStep).not.toContain('cargo fetch --locked');
+
+    const nativeJob = jobSection('native-shell-tests');
+    expect(
+      nativeJob.indexOf('Prepare standalone Rust crate dependencies'),
+    ).toBeLessThan(nativeJob.indexOf('run: npm run check:native-shells'));
+  });
 });