整理项目记忆与Agent RAG入口

迁移项目共享记忆到 docs/project-memory，保留 .hermes 仅作为工具目录

新增 Agent 本地 RAG 索引与上下文包检索脚本

记录 RAG 依赖只安装到 .rag/runtime 并加入忽略规则

同步文档与检查脚本中的项目记忆路径

scripts/check-visual-novel-vn11-negative-scan.mjs

@@ -7,7 +7,7 @@ const reportPath = join(repoRoot, '.tmp', 'VN11_NEGATIVE_SCAN_REPORT_2026-05-07.
 
 const documentTargets = [
   'docs',
-  '.hermes/shared-memory',
+  'docs/project-memory/shared-memory',
 ];
 
 const visualNovelImplementationTargets = [
@@ -202,7 +202,7 @@ const reportLines = [
   '## 扫描范围',
   '',
   '- 视觉小说工程代码：视觉小说前端、service、shared contracts、Rust contracts、module、api-server、SpacetimeDB schema 与 facade 路径',
-  '- 文档与共享记忆：`docs/`、`.hermes/shared-memory/`',
+  '- 文档与共享记忆：`docs/`、`docs/project-memory/shared-memory/`',
   '- 外部平台误入复核：视觉小说前端、service、shared contracts、Rust contracts、module、api-server、SpacetimeDB schema 与 facade 路径',
   '',
   '## 扫描结论',