整理项目记忆与Agent RAG入口

迁移项目共享记忆到 docs/project-memory，保留 .hermes 仅作为工具目录

新增 Agent 本地 RAG 索引与上下文包检索脚本

记录 RAG 依赖只安装到 .rag/runtime 并加入忽略规则

同步文档与检查脚本中的项目记忆路径

.hermes/skills/genarrative-dev-stack-port-routing/SKILL.md

@@ -21,7 +21,7 @@ metadata:
 - 处理 `3000`、`3101`、`3102`、`8082` 等端口被占用导致本地开发栈启动失败。
 - 排查 Vite 代理仍指向旧 api-server 端口、前端打开了旧 dev server、后台代理错配。
 - 调整 SpacetimeDB standalone、publish、Rust `api-server`、主站 Vite、后台 Vite 的启动顺序。
-- 修改本地联调文档或 `.hermes/shared-memory/pitfalls.md` 中的 dev 启动口径。
+- 修改本地联调文档或 `docs/project-memory/shared-memory/pitfalls.md` 中的 dev 启动口径。
 
 ## 当前端口职责
 
@@ -75,7 +75,7 @@ Linux 多用户并发开发时，`GENARRATIVE_DEV_PORT_RANGE` 或 `--port-range`
    - `scripts/dev.mjs`
    - `scripts/dev-utils.mjs`
    - `docs/technical/RUST_LOCAL_AND_REMOTE_DEPLOYMENT_SCRIPTS_2026-04-22.md`
-   - `.hermes/shared-memory/pitfalls.md`
+   - `docs/project-memory/shared-memory/pitfalls.md`
 2. 优先改公共端口工具，不要把端口探测逻辑复制到多个脚本。
 3. 修改 `scripts/dev.mjs` 时确认变量顺序：先解析参数和端口，再构造 `SPACETIME_SERVER` / `RUST_SERVER_TARGET`，最后启动对应 service。
 4. 修改 watch 时保持模块边界：SpacetimeDB 只监听 `spacetime-module` 且改动后重新 publish，不重启 standalone 宿主；api-server 排除 `spacetime-module`；web/admin-web 源码变化交给 Vite 自身 HMR，外层调度器不要再监听前端目录重启 Vite。
@@ -124,5 +124,5 @@ node scripts/dev-stack-port-utils.mjs resolve-dev-stack spacetime:127.0.0.1:0 ap
 - [ ] `npm run dev` 的 SpacetimeDB、publish、api-server、主站 Vite、后台 Vite 都使用实际端口。
 - [ ] `npm run dev:web` 在主站端口不可用时能切换到可用端口。
 - [ ] 文档同步更新 `docs/technical/RUST_LOCAL_AND_REMOTE_DEPLOYMENT_SCRIPTS_2026-04-22.md`。
-- [ ] 长期踩坑同步更新 `.hermes/shared-memory/pitfalls.md`。
+- [ ] 长期踩坑同步更新 `docs/project-memory/shared-memory/pitfalls.md`。
 - [ ] 修改中文文件后运行 `npm run check:encoding`。