整理项目记忆与Agent RAG入口

迁移项目共享记忆到 docs/project-memory，保留 .hermes 仅作为工具目录

新增 Agent 本地 RAG 索引与上下文包检索脚本

记录 RAG 依赖只安装到 .rag/runtime 并加入忽略规则

同步文档与检查脚本中的项目记忆路径

.hermes/README.md

@@ -1,30 +1,21 @@
-# Genarrative 团队 Hermes 共享记忆
+# Genarrative Hermes 工具目录
 
-本目录用于在仓库内共享团队级 Hermes 上下文，供 3 名开发人员在各自本地 Hermes 中读取、更新和同步。
+本目录只保留 Hermes 专用的仓库级工具资源，例如 Hermes skills、plugins 和启用说明。项目知识本体、长期记忆、计划和 TODO 不再放在 `.hermes/`，统一迁移到 `docs/project-memory/`。
 
 ## 使用原则
 
-- `.hermes/` 中只保存可以进入 Git 的团队共享内容。
+- `.hermes/` 中只保存 Hermes 工具运行或加载所需内容。
+- 项目长期知识、架构约定、排障经验、协作规则、计划和 TODO 统一放在 `docs/project-memory/`。
 - 不提交个人配置、API Key、会话转录、模型密钥、本地路径密钥等敏感内容。
 - 个人 Hermes 的 `~/.hermes/config.yaml`、`~/.hermes/.env`、`~/.hermes/sessions/` 不应复制到本仓库。
-- 开发前先阅读本目录下与任务相关的记忆文件；开发后如产生稳定知识，更新对应文档。
 - 后续新增的 Markdown 文档文件名必须以分类标签开头，格式为 `【标签名】中文标题-日期.md`，便于团队跨目录检索。
-- 若本目录内容与 `docs/` 或代码事实冲突，以当前代码和最新 `docs/` 为准，并同步修正过期记忆。
-- 阶段性计划、一次性 TODO 和已关闭实验不再长期沉淀为仓库文档；仍有效内容应合并进 `docs/` 当前融合文档或 `.hermes/shared-memory/`。
+- 若 `.hermes/` 中的工具说明与代码或 `docs/` 冲突，以当前代码和最新 `docs/` 为准。
 
 ## 目录结构
 
 ```text
 .hermes/
-├─ README.md                         # 本说明
-├─ shared-memory/
-│  ├─ project-overview.md            # 项目概览与当前技术路线
-│  ├─ team-conventions.md            # 团队协作约定
-│  ├─ development-workflow.md        # 开发、测试、提交流程
-│  ├─ document-map.md                # README / AGENTS / docs 阅读索引
-│  ├─ decision-log.md                # 长期决策记录
-│  ├─ pitfalls.md                    # 踩坑与排障记录
-│  └─ handoff-template.md            # 任务交接模板
+├─ README.md                         # Hermes 工具目录说明
 ├─ skills/                           # 仓库级 Hermes skills
 └─ plugins/                          # 仓库级 Hermes plugins（需显式启用项目 plugin）
 ```
@@ -71,22 +62,5 @@ HERMES_ENABLE_PROJECT_PLUGINS=1 HERMES_PLUGINS_DEBUG=1 hermes chat -q "请读取
 在本仓库中开始复杂任务时，可以先对 Hermes 说：
 
 ```text
-请先读取 AGENTS.md 以及 .hermes/shared-memory/ 下与本任务相关的团队共享记忆，再开始分析。若任务完成后产生稳定项目知识，请更新 .hermes/shared-memory/ 对应文件。
+请先读取 AGENTS.md 以及 docs/project-memory/shared-memory/ 下与本任务相关的团队共享记忆，再开始分析。若任务完成后产生稳定项目知识，请更新 docs/project-memory/shared-memory/ 对应文件。
 ```
-
-## 需要沉淀到这里的内容
-
-- 长期有效的架构约定
-- 反复会用到的本地开发/测试流程
-- 已确认的接口契约或模块边界
-- 重要技术决策及原因
-- 踩坑、排障方式、验证命令
-- 团队协作规则和任务交接规范
-
-## 不应沉淀到这里的内容
-
-- API Key、Token、Cookie、私有密钥
-- 个人账号、个人本地绝对路径、个人隐私信息
-- 大段临时聊天记录
-- 尚未确认的一次性猜测
-- 构建产物、日志、缓存、数据库 dump